Synonimy |
Zależna od ATP ligaza RNA, b1-10t, ligaza RNA bakteriofaga, białko pasma IV, ligaza klasy I, ligaza RNA klasy I rybozym, DraRnI, DraRnl, DREL, gp24.1, P52, faga Rnl2, syntetaza polinukleotydowa, ligaza polirybonukleotydowa, polibrydonukleotyd syntaza (ATP), REL1, ligaza rybonukleinowa, kompleks edycji rybonuklerotein, ligaza RNA RM378, ligaza RNA 1, ligaza RNA, ligaza RNA (ATP), ligaza RNA 1, ligaza RNA 2, ligaza RNA rybozym, ligaza edycyjna RNA 1, RNL, Rnl1, Rnl2, Rnl5, RnlA, RtcA, rtcB, syntetaza, poliribonukleotyd, ligaza RNA T4, ligaza RNA 4 T1, ligaza 4 RNA T2, T4Rnl2, TbMP52, TbREL1, termostabilna ligaza RNA 1 |
Komentarze |
Enzym katalizuje ligację nici RNA z końcami 3'-hydroksylowymi i 5'-fosforanowymi, tworząc fosfodiester i uszczelniając pewne typy pęknięć pojedynczej nici w RNA. Kataliza zachodzi w trzystopniowym mechanizmie, zaczynając od aktywacji enzymu przez ATP, tworząc wiązanie fosforamidowe między adenylanem a resztą lizyny. Grupa adenylanowa jest następnie przenoszona na koniec 5'-fosforanowy substratu, tworząc zamkniętą strukturę 5 '- (5'-difosfoadenozyny) - [RNA]. Wreszcie, enzym katalizuje nukleofilowy atak końca 3'-OH na końcu zakrytym, co powoduje utworzenie wiązania fosfodiestrowego i uwolnienie adenylanu. |