Synonimy |
ligaza DNA zależna od beta-NAD +, ligaza DNA zależna od beta-NAD +, ligaza dezoksyrybonukleinowa, ligaza kwasu deoksyrybonukleinowego, ligaza kwasu deoksyrybonukleinowego, ligaza deoksyrybonukleinowa, ligaza deoksyrybonukleinowa, enzym naprawczy deoksyrybonukleinowy DNA, ligaza DNA dezoksyrybonukleinowa, (NAD), enzym naprawy DNA, enzym łączący DNA, LigA, Ligaza, polinukleotyd (dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy), LigN, MimiLIG, ligaza DNA MsEPV, MtuLigA, NAD (+) - ligaza DNA, ligaza DNA zależna od NAD +, NAD + DNA ligaza, ligaza DNA zależna od NAD +, ligaza DNA zależna od NAD +, ligaza DNA zależna od NAD, NDL, syntaza polideoksyrybonukleotydowa (NAD +), syntaza polideoksyrybonukleotydowa [NAD +], ligaza polinukleotydowa, syntetaza polinukleotydowa, syntaza dinukleotydowa dinukleinydowa 3014 (NAD). , Syntetaza, polidoksyrybonukleotyd (dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy), ligaza DNA T4, ligaza Taq DNA, ligaza Tfi DNA, ligaza Tth DNA, wBm-LigA |
Komentarze |
Enzym, zwykle występujący w bakteriach, katalizuje ligację nici DNA z końcami 3'-hydroksylowymi i 5'-fosforanowymi, tworząc fosfodiester i uszczelniając pewne typy pęknięć pojedynczych nici w dupleksowym DNA. Kataliza zachodzi w trzystopniowym mechanizmie, zaczynając od aktywacji enzymu przez NAD +, tworząc wiązanie fosforoamidowe między adenylanem a resztą lizyny. Grupa adenylanowa jest następnie przenoszona na koniec 5'-fosforanowy substratu, tworząc zamkniętą strukturę 5 '- (5'-difosfoadenozyny) - [DNA]. Wreszcie, enzym katalizuje nukleofilowy atak końca 3'-OH na końcu zakrytym, co powoduje utworzenie wiązania fosfodiestrowego i uwolnienie adenylanu. RNA może również w pewnym stopniu działać jako substrat .?cf. EC ™ 6.5.1.1, ligaza DNA (ATP), EC ™ 6.5.1.6, ligaza DNA (ATP lub NAD +) i EC ™ 6.5.1.7, ligaza DNA (ATP, ADP lub GTP). |