Ligaza DNA (ATP lub NAD+) EC#: 6.5.1.6; ChemWhat Kod: 1383898

Nazwa produktu Ligaza DNA (ATP lub NAD +)
Przykładowa struktura Przykład Struktura ligazy DNA (ATP lub NAD +) EC #: 6.5.1.6
Synonimy Ligaza DNA Tfu
Numer WE 6.5.1.6
Numer rejestru CAS
Komentarze Enzymy z archeonów „Thermococcus fumicolans” i „Thermococcus onnurineus” wykazują wysoką aktywność z ATP lub NAD + i znacznie niższą aktywność w przypadku TTP, GTP i CTP. Enzym katalizuje ligację nici DNA z końcami 3'-hydroksylowymi i 5'-fosforanowymi, tworząc fosfodiester i uszczelniając pewne typy pęknięć jednoniciowych w dupleksowym DNA. Kataliza zachodzi w trzystopniowym mechanizmie, zaczynając od aktywacji enzymu przez ATP lub NAD +, tworząc wiązanie fosforoamidowe między adenylanem a resztą lizyny. Grupa adenylanowa jest następnie przenoszona na koniec 5'-fosforanowy substratu, tworząc zamkniętą strukturę 5 '- (5'-difosfoadenozyny) - [DNA]. Wreszcie, enzym katalizuje nukleofilowy atak końca 3'-OH na końcu zakrytym, co powoduje utworzenie wiązania fosfodiestrowego i uwolnienie adenylanu. Różni się od EC ™ 6.5.1.1, ligaza DNA (ATP), EC ™ 6.5.1.2, ligaza DNA (NAD +) i EC ™ 6.5.1.7, ligaza DNA (ATP, ADP lub GTP).
Kofaktor
Historia
Reakcje (1) Atp + (deoksyrybonukleotyd) (n) -3′-hydroksyl + 5′-fosfo- (deoksyrybonukleotyd) (m) = (deoksyrybonukleotyd) (n + m) + Amp + difosforan. (2) NAD (+) + (deoksyrybonukleotyd) (n) -3′-hydroksyl + 5′-fosfo- (deoksyrybonukleotyd) (m) = (deoksyrybonukleotyd) (n + m) + Amp + D-nukleotyd beta-nikotynamidu.

Kup odczynnik

Brak dostawcy odczynników? Wyślij szybkie zapytanie do ChemWhat
Chcesz być wymieniony tutaj jako dostawca odczynników? (Usługa płatna) Kliknij tutaj, aby się skontaktować ChemWhat

Zatwierdzeni producenci

Chcesz być wymieniony jako zatwierdzony producent (wymaga zatwierdzenia)? Proszę pobrać i wypełnić ta forma i odeślij do [email chroniony]

Skontaktuj się z nami, aby uzyskać inną pomoc

Skontaktuj się z nami, aby uzyskać inne informacje lub usługi Kliknij tutaj, aby się skontaktować ChemWhat