Ligaza DNA (ATP lub NAD+) EC#: 6.5.1.6; ChemWhat Kod: 1383898
Nazwa produktu | Ligaza DNA (ATP lub NAD +) |
Przykładowa struktura | |
Synonimy | Ligaza DNA Tfu |
Numer WE | 6.5.1.6 |
Numer rejestru CAS | |
Komentarze | Enzymy z archeonów „Thermococcus fumicolans” i „Thermococcus onnurineus” wykazują wysoką aktywność z ATP lub NAD + i znacznie niższą aktywność w przypadku TTP, GTP i CTP. Enzym katalizuje ligację nici DNA z końcami 3'-hydroksylowymi i 5'-fosforanowymi, tworząc fosfodiester i uszczelniając pewne typy pęknięć jednoniciowych w dupleksowym DNA. Kataliza zachodzi w trzystopniowym mechanizmie, zaczynając od aktywacji enzymu przez ATP lub NAD +, tworząc wiązanie fosforoamidowe między adenylanem a resztą lizyny. Grupa adenylanowa jest następnie przenoszona na koniec 5'-fosforanowy substratu, tworząc zamkniętą strukturę 5 '- (5'-difosfoadenozyny) - [DNA]. Wreszcie, enzym katalizuje nukleofilowy atak końca 3'-OH na końcu zakrytym, co powoduje utworzenie wiązania fosfodiestrowego i uwolnienie adenylanu. Różni się od EC ™ 6.5.1.1, ligaza DNA (ATP), EC ™ 6.5.1.2, ligaza DNA (NAD +) i EC ™ 6.5.1.7, ligaza DNA (ATP, ADP lub GTP). |
Kofaktor | |
Historia | |
Reakcje | (1) Atp + (deoksyrybonukleotyd) (n) -3′-hydroksyl + 5′-fosfo- (deoksyrybonukleotyd) (m) = (deoksyrybonukleotyd) (n + m) + Amp + difosforan. (2) NAD (+) + (deoksyrybonukleotyd) (n) -3′-hydroksyl + 5′-fosfo- (deoksyrybonukleotyd) (m) = (deoksyrybonukleotyd) (n + m) + Amp + D-nukleotyd beta-nikotynamidu. |
Kup odczynnik | |
Brak dostawcy odczynników? | Wyślij szybkie zapytanie do ChemWhat |
Chcesz być wymieniony tutaj jako dostawca odczynników? (Usługa płatna) | Kliknij tutaj, aby się skontaktować ChemWhat |
Zatwierdzeni producenci | |
Chcesz być wymieniony jako zatwierdzony producent (wymaga zatwierdzenia)? | Proszę pobrać i wypełnić ta forma i odeślij do [email chroniony] |
Skontaktuj się z nami, aby uzyskać inną pomoc | |
Skontaktuj się z nami, aby uzyskać inne informacje lub usługi | Kliknij tutaj, aby się skontaktować ChemWhat |